FC Sion: Der Zentralvorstand des SFV hat gegen den FC Sion mit Entscheid vom 30.12.2011 den Abzug von 36 Punkten angeordnet. Der Entscheid kann nicht bei Instanzen des SFV angefochten werden, entsprechend ist der Punktabzug in der Tabelle bereits berücksichtigt.

Neuchâtel Xamax FC: Mit Entscheid vom 18.1.2012 hat die Disziplinarkommission der SFL Neuchâtel Xamax mit sofortiger Wirkung die Lizenz entzogen. Damit ist der Klub aus der Meisterschaft der Axpo Super League ausgeschlossen und nicht mehr Mitglied der Swiss Football League. Die Resultate von Xamax aus der 1. Phase der Meisterschaft bleiben in der Wertung, die Spiele des Klubs in der 2. Phase entfallen. Am 26.1.2012 wurde zudem ein Konkursverfahren gegen die Neuchâtel Xamax SA eröffnet.